Masjid MI PLUS DARUSSAADAH LIRBOYO menjadi sarana utama pembinaan spiritual siswa. Masjid ini digunakan untuk kegiatan ibadah harian, pembelajaran Al-Qur’an, serta pembiasaan akhlak dan karakter Islami. Dengan ruang yang bersih, tertata, dan nyaman, masjid mendukung pelaksanaan kegiatan keagamaan secara khidmat dan disiplin, sehingga membentuk lingkungan madrasah yang religius dan berwawasan moral.